Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Hoxc5P32043 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hoxc5P32043 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms