Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Saa4P31532 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Saa4P31532 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Saa4P31532 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa4P31532 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa4P31532 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa4P31532 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Saa4P31532 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms