Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VtnP29788 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VtnP29788 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VtnP29788 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VtnP29788 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VtnP29788 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VtnP29788 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VtnP29788 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VtnP29788 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
VtnP29788 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VtnP29788 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
VtnP29788 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VtnP29788 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
VtnP29788 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VtnP29788 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
VtnP29788 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VtnP29788 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VtnP29788 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VtnP29788 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VtnP29788 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VtnP29788 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VtnP29788 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VtnP29788 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VtnP29788 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VtnP29788 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
VtnP29788 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VtnP29788 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
VtnP29788 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VtnP29788 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VtnP29788 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VtnP29788 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
VtnP29788 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
VtnP29788 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VtnP29788 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VtnP29788 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
VtnP29788 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VtnP29788 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VtnP29788 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VtnP29788 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VtnP29788 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VtnP29788 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VtnP29788 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VtnP29788 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
VtnP29788 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VtnP29788 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
VtnP29788 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VtnP29788 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VtnP29788 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VtnP29788 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VtnP29788 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VtnP29788 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VtnP29788 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VtnP29788 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VtnP29788 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VtnP29788 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VtnP29788 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VtnP29788 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VtnP29788 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VtnP29788 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VtnP29788 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VtnP29788 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
VtnP29788 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VtnP29788 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
VtnP29788 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
VtnP29788 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VtnP29788 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VtnP29788 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VtnP29788 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VtnP29788 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VtnP29788 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VtnP29788 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
VtnP29788 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VtnP29788 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VtnP29788 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VtnP29788 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
VtnP29788 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VtnP29788 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VtnP29788 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VtnP29788 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VtnP29788 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VtnP29788 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VtnP29788 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VtnP29788 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VtnP29788 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VtnP29788 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VtnP29788 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VtnP29788 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
VtnP29788 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VtnP29788 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VtnP29788 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
VtnP29788 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VtnP29788 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
VtnP29788 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VtnP29788 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VtnP29788 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VtnP29788 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VtnP29788 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VtnP29788 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VtnP29788 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
VtnP29788 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms