Protein–RNA interactions for Protein: P29594

Casp2, Caspase-2, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp2P29594 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp2P29594 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp2P29594 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp2P29594 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp2P29594 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Casp2P29594 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp2P29594 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp2P29594 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp2P29594 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp2P29594 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp2P29594 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp2P29594 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp2P29594 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp2P29594 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp2P29594 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Casp2P29594 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp2P29594 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp2P29594 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp2P29594 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp2P29594 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp2P29594 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Casp2P29594 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Casp2P29594 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Casp2P29594 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Casp2P29594 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp2P29594 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp2P29594 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp2P29594 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Casp2P29594 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp2P29594 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp2P29594 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp2P29594 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp2P29594 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp2P29594 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp2P29594 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp2P29594 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp2P29594 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp2P29594 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp2P29594 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Casp2P29594 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms