Protein–RNA interactions for Protein: P29533

Vcam1, Vascular cell adhesion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcam1P29533 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vcam1P29533 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vcam1P29533 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vcam1P29533 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.1 ms