Protein–RNA interactions for Protein: P28659

Celf1, CUGBP Elav-like family member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Celf1P28659 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Celf1P28659 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Celf1P28659 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Celf1P28659 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Celf1P28659 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Celf1P28659 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Celf1P28659 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Celf1P28659 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Celf1P28659 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Celf1P28659 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Celf1P28659 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Celf1P28659 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Celf1P28659 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Celf1P28659 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Celf1P28659 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Celf1P28659 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Celf1P28659 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Celf1P28659 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Celf1P28659 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Celf1P28659 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Celf1P28659 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Celf1P28659 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Celf1P28659 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Celf1P28659 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Celf1P28659 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Celf1P28659 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Celf1P28659 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Celf1P28659 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Celf1P28659 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Celf1P28659 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Celf1P28659 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Celf1P28659 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Celf1P28659 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Celf1P28659 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Celf1P28659 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Celf1P28659 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Celf1P28659 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Celf1P28659 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Celf1P28659 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Celf1P28659 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Celf1P28659 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Celf1P28659 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Celf1P28659 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Celf1P28659 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Celf1P28659 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Celf1P28659 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Celf1P28659 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Celf1P28659 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Celf1P28659 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Celf1P28659 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Celf1P28659 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Celf1P28659 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Celf1P28659 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Celf1P28659 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Celf1P28659 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Celf1P28659 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Celf1P28659 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Celf1P28659 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Celf1P28659 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms