Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Hoxd10P28359 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Hoxd10P28359 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Hoxd10P28359 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms