Protein–RNA interactions for Protein: P28271

Aco1, Cytoplasmic aconitate hydratase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aco1P28271 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Aco1P28271 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Aco1P28271 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aco1P28271 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aco1P28271 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aco1P28271 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Aco1P28271 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aco1P28271 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Aco1P28271 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aco1P28271 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aco1P28271 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aco1P28271 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Aco1P28271 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms