Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gjb1P28230 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gjb1P28230 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms