Protein–RNA interactions for Protein: P26231

Ctnna1, Catenin alpha-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna1P26231 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnna1P26231 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnna1P26231 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ctnna1P26231 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ctnna1P26231 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ctnna1P26231 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms