Protein–RNA interactions for Protein: P23298

Prkch, Protein kinase C eta type, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkchP23298 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkchP23298 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkchP23298 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkchP23298 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkchP23298 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkchP23298 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkchP23298 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PrkchP23298 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkchP23298 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkchP23298 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkchP23298 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkchP23298 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkchP23298 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkchP23298 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
PrkchP23298 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkchP23298 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkchP23298 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkchP23298 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkchP23298 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkchP23298 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkchP23298 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PrkchP23298 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms