Protein–RNA interactions for Protein: P22893

Zfp36, mRNA decay activator protein ZFP36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36P22893 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Zfp36P22893 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Zfp36P22893 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zfp36P22893 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms