Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Clk1P22518 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clk1P22518 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clk1P22518 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Clk1P22518 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clk1P22518 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk1P22518 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clk1P22518 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clk1P22518 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clk1P22518 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clk1P22518 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Clk1P22518 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms