Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmnb2P21619 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmnb2P21619 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmnb2P21619 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmnb2P21619 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmnb2P21619 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmnb2P21619 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmnb2P21619 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lmnb2P21619 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lmnb2P21619 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lmnb2P21619 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms