Protein–RNA interactions for Protein: P20615

Hoxb9, Homeobox protein Hox-B9, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb9P20615 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Hoxb9P20615 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Hoxb9P20615 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms