Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ms4a2P20490 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ms4a2P20490 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ms4a2P20490 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms