Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PrkcaP20444 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PrkcaP20444 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms