Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ntf3P20181 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ntf3P20181 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Ntf3P20181 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74 ms