Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ifrd1P19182 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ifrd1P19182 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ifrd1P19182 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms