Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tnnc1P19123 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tnnc1P19123 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms