Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sdc1P18828 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sdc1P18828 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms