Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Rps6ka1P18653 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps6ka1P18653 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms