Protein–RNA interactions for Protein: P18529

Ig heavy chain V region 5-76, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18529 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P18529 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18529 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18529 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18529 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P18529 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18529 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18529 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P18529 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18529 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18529 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18529 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18529 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18529 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P18529 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18529 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18529 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18529 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18529 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18529 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18529 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18529 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18529 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18529 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18529 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18529 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P18529 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18529 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18529 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18529 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18529 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18529 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18529 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18529 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P18529 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P18529 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P18529 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P18529 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P18529 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P18529 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P18529 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18529 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18529 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18529 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18529 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18529 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18529 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18529 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18529 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18529 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P18529 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18529 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18529 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18529 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18529 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18529 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18529 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18529 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18529 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18529 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18529 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18529 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18529 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18529 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P18529 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18529 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18529 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18529 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18529 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18529 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18529 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18529 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18529 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18529 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18529 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18529 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18529 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18529 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18529 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18529 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18529 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P18529 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18529 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18529 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18529 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18529 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18529 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18529 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18529 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18529 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18529 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18529 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18529 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18529 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18529 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18529 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P18529 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18529 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18529 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P18529 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms