Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PcnaP17918 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PcnaP17918 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PcnaP17918 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PcnaP17918 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PcnaP17918 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PcnaP17918 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PcnaP17918 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
PcnaP17918 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PcnaP17918 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PcnaP17918 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PcnaP17918 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
PcnaP17918 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PcnaP17918 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PcnaP17918 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PcnaP17918 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PcnaP17918 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PcnaP17918 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PcnaP17918 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PcnaP17918 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
PcnaP17918 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PcnaP17918 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PcnaP17918 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PcnaP17918 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PcnaP17918 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PcnaP17918 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PcnaP17918 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PcnaP17918 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PcnaP17918 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PcnaP17918 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
PcnaP17918 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
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