Protein–RNA interactions for Protein: P17532

Tph1, Tryptophan 5-hydroxylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tph1P17532 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tph1P17532 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tph1P17532 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tph1P17532 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tph1P17532 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tph1P17532 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tph1P17532 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tph1P17532 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tph1P17532 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tph1P17532 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tph1P17532 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tph1P17532 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tph1P17532 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tph1P17532 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tph1P17532 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tph1P17532 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tph1P17532 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tph1P17532 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tph1P17532 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tph1P17532 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tph1P17532 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tph1P17532 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tph1P17532 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tph1P17532 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tph1P17532 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tph1P17532 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms