Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rag1P15919 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rag1P15919 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rag1P15919 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rag1P15919 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rag1P15919 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rag1P15919 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rag1P15919 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rag1P15919 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rag1P15919 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms