Protein–RNA interactions for Protein: P15533

Trim30a, Tripartite motif-containing protein 30A, mousemouse

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30aP15533 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim30aP15533 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim30aP15533 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim30aP15533 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms