Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd44P15379 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Cd44P15379 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd44P15379 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd44P15379 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd44P15379 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cd44P15379 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Cd44P15379 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd44P15379 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd44P15379 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Cd44P15379 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd44P15379 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd44P15379 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd44P15379 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd44P15379 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd44P15379 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Cd44P15379 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd44P15379 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd44P15379 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd44P15379 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd44P15379 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd44P15379 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd44P15379 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd44P15379 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd44P15379 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd44P15379 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd44P15379 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd44P15379 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Cd44P15379 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd44P15379 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd44P15379 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd44P15379 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd44P15379 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd44P15379 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd44P15379 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd44P15379 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd44P15379 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd44P15379 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd44P15379 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd44P15379 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd44P15379 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd44P15379 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Cd44P15379 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms