Protein–RNA interactions for Protein: P14427

H2-D1, H-2 class I histocompatibility antigen, D-P alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-D1P14427 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-D1P14427 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-D1P14427 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-D1P14427 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-D1P14427 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-D1P14427 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-D1P14427 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
H2-D1P14427 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-D1P14427 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-D1P14427 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-D1P14427 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-D1P14427 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-D1P14427 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
H2-D1P14427 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
H2-D1P14427 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-D1P14427 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-D1P14427 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-D1P14427 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-D1P14427 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-D1P14427 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-D1P14427 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-D1P14427 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-D1P14427 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
H2-D1P14427 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-D1P14427 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-D1P14427 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-D1P14427 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-D1P14427 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-D1P14427 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-D1P14427 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-D1P14427 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-D1P14427 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-D1P14427 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-D1P14427 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-D1P14427 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-D1P14427 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-D1P14427 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-D1P14427 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
H2-D1P14427 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-D1P14427 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-D1P14427 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-D1P14427 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-D1P14427 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
H2-D1P14427 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms