Protein–RNA interactions for Protein: P13372

Vpreb1, Immunoglobulin iota chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb1P13372 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Vpreb1P13372 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Vpreb1P13372 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms