Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Nr4a1P12813 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nr4a1P12813 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms