Protein–RNA interactions for Protein: P11087

Col1a1, Collagen alpha-1(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a1P11087 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Col1a1P11087 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Col1a1P11087 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col1a1P11087 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms