Protein–RNA interactions for Protein: P11031

Sub1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sub1P11031 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Sub1P11031 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sub1P11031 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Sub1P11031 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sub1P11031 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sub1P11031 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sub1P11031 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sub1P11031 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Sub1P11031 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms