Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cd8bP10300 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cd8bP10300 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cd8bP10300 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms