Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myod1P10085 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myod1P10085 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myod1P10085 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Myod1P10085 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Myod1P10085 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myod1P10085 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Myod1P10085 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms