Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Dnmt3cP0DOY1 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Dnmt3cP0DOY1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dnmt3cP0DOY1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dnmt3cP0DOY1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dnmt3cP0DOY1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dnmt3cP0DOY1 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dnmt3cP0DOY1 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dnmt3cP0DOY1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dnmt3cP0DOY1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dnmt3cP0DOY1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Dnmt3cP0DOY1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnmt3cP0DOY1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnmt3cP0DOY1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnmt3cP0DOY1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnmt3cP0DOY1 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnmt3cP0DOY1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnmt3cP0DOY1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnmt3cP0DOY1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Dnmt3cP0DOY1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms