Protein–RNA interactions for Protein: P0C871

Pla2g4b, Cytosolic phospholipase A2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pla2g4bP0C871 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Pla2g4bP0C871 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Pla2g4bP0C871 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms