Protein–RNA interactions for Protein: P0C7N9

Psmg4, Proteasome assembly chaperone 4, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmg4P0C7N9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmg4P0C7N9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Psmg4P0C7N9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms