Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprqP0C5E4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprqP0C5E4 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.04■□□□□ -0
PtprqP0C5E4 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PtprqP0C5E4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprqP0C5E4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprqP0C5E4 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprqP0C5E4 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprqP0C5E4 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprqP0C5E4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
PtprqP0C5E4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
PtprqP0C5E4 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprqP0C5E4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprqP0C5E4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprqP0C5E4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprqP0C5E4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.03■□□□□ -0
PtprqP0C5E4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprqP0C5E4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprqP0C5E4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
PtprqP0C5E4 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PtprqP0C5E4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprqP0C5E4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprqP0C5E4 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
PtprqP0C5E4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
PtprqP0C5E4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
PtprqP0C5E4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
PtprqP0C5E4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PtprqP0C5E4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms