Protein–RNA interactions for Protein: P09084

Pax1, Paired box protein Pax-1, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax1P09084 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pax1P09084 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pax1P09084 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax1P09084 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pax1P09084 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax1P09084 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax1P09084 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax1P09084 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pax1P09084 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms