Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hoxd3P09027 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Hoxd3P09027 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Hoxd3P09027 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms