Protein–RNA interactions for Protein: P09025

Hoxc8, Homeobox protein Hox-C8, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc8P09025 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hoxc8P09025 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Hoxc8P09025 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hoxc8P09025 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms