Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxb7P09024 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxb7P09024 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxb7P09024 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxb7P09024 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxb7P09024 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxb7P09024 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxb7P09024 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxb7P09024 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxb7P09024 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxb7P09024 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hoxb7P09024 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Hoxb7P09024 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxb7P09024 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxb7P09024 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms