Protein–RNA interactions for Protein: P09022

Hoxa1, Homeobox protein Hox-A1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa1P09022 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hoxa1P09022 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Hoxa1P09022 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms