Protein–RNA interactions for Protein: P08551

Nefl, Neurofilament light polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeflP08551 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NeflP08551 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NeflP08551 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NeflP08551 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NeflP08551 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NeflP08551 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NeflP08551 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NeflP08551 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NeflP08551 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NeflP08551 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NeflP08551 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NeflP08551 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NeflP08551 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NeflP08551 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NeflP08551 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NeflP08551 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NeflP08551 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NeflP08551 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NeflP08551 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NeflP08551 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NeflP08551 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NeflP08551 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NeflP08551 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NeflP08551 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NeflP08551 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NeflP08551 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NeflP08551 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NeflP08551 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NeflP08551 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NeflP08551 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NeflP08551 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NeflP08551 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NeflP08551 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NeflP08551 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NeflP08551 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NeflP08551 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NeflP08551 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NeflP08551 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NeflP08551 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NeflP08551 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NeflP08551 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NeflP08551 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NeflP08551 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NeflP08551 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NeflP08551 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NeflP08551 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NeflP08551 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NeflP08551 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NeflP08551 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NeflP08551 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NeflP08551 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NeflP08551 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NeflP08551 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NeflP08551 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NeflP08551 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NeflP08551 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NeflP08551 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NeflP08551 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NeflP08551 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NeflP08551 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NeflP08551 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NeflP08551 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NeflP08551 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NeflP08551 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NeflP08551 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NeflP08551 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NeflP08551 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NeflP08551 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NeflP08551 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NeflP08551 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NeflP08551 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NeflP08551 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NeflP08551 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
NeflP08551 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NeflP08551 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NeflP08551 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NeflP08551 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NeflP08551 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NeflP08551 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NeflP08551 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NeflP08551 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NeflP08551 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NeflP08551 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NeflP08551 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NeflP08551 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NeflP08551 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NeflP08551 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NeflP08551 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NeflP08551 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NeflP08551 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NeflP08551 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NeflP08551 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NeflP08551 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NeflP08551 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NeflP08551 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NeflP08551 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NeflP08551 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NeflP08551 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NeflP08551 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NeflP08551 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms