Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Me1P06801 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Me1P06801 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Me1P06801 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Me1P06801 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Me1P06801 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Me1P06801 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Me1P06801 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Me1P06801 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Me1P06801 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Me1P06801 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Me1P06801 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Me1P06801 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Me1P06801 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Me1P06801 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Me1P06801 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Me1P06801 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Me1P06801 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Me1P06801 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Me1P06801 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Me1P06801 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Me1P06801 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Me1P06801 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Me1P06801 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Me1P06801 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Me1P06801 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Me1P06801 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Me1P06801 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Me1P06801 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Me1P06801 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Me1P06801 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Me1P06801 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Me1P06801 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Me1P06801 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Me1P06801 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Me1P06801 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Me1P06801 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Me1P06801 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Me1P06801 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Me1P06801 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Me1P06801 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Me1P06801 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Me1P06801 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Me1P06801 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Me1P06801 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Me1P06801 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Me1P06801 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Me1P06801 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Me1P06801 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Me1P06801 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Me1P06801 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Me1P06801 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Me1P06801 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Me1P06801 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Me1P06801 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Me1P06801 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Me1P06801 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Me1P06801 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Me1P06801 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Me1P06801 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Me1P06801 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Me1P06801 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Me1P06801 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Me1P06801 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Me1P06801 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Me1P06801 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Me1P06801 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Me1P06801 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Me1P06801 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Me1P06801 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Me1P06801 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Me1P06801 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Me1P06801 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Me1P06801 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Me1P06801 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Me1P06801 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Me1P06801 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Me1P06801 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Me1P06801 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Me1P06801 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Me1P06801 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Me1P06801 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Me1P06801 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Me1P06801 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Me1P06801 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Me1P06801 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Me1P06801 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Me1P06801 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Me1P06801 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Me1P06801 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Me1P06801 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Me1P06801 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Me1P06801 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Me1P06801 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Me1P06801 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Me1P06801 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Me1P06801 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Me1P06801 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Me1P06801 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Me1P06801 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms