Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P06321 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
P06321 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P06321 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P06321 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P06321 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P06321 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
P06321 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P06321 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P06321 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P06321 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P06321 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06321 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06321 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06321 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06321 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P06321 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P06321 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06321 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06321 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P06321 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06321 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06321 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P06321 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06321 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06321 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06321 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P06321 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06321 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06321 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06321 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06321 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06321 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06321 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06321 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06321 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06321 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06321 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06321 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06321 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06321 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06321 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06321 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06321 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P06321 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06321 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06321 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06321 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06321 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06321 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06321 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06321 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P06321 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06321 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06321 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06321 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06321 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06321 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06321 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06321 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06321 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06321 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06321 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06321 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P06321 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P06321 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P06321 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P06321 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P06321 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P06321 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P06321 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P06321 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P06321 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P06321 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P06321 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P06321 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P06321 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
P06321 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P06321 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P06321 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
P06321 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P06321 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P06321 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P06321 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P06321 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P06321 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18■□□□□ 0.47
P06321 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
P06321 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
P06321 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P06321 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P06321 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
P06321 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06321 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06321 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06321 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06321 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06321 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P06321 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06321 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P06321 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms