Protein–RNA interactions for Protein: P05201

Got1, Aspartate aminotransferase, cytoplasmic, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Got1P05201 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Got1P05201 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Got1P05201 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Got1P05201 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Got1P05201 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Got1P05201 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Got1P05201 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Got1P05201 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Got1P05201 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Got1P05201 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Got1P05201 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Got1P05201 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Got1P05201 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Got1P05201 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Got1P05201 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Got1P05201 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Got1P05201 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Got1P05201 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Got1P05201 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Got1P05201 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Got1P05201 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Got1P05201 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Got1P05201 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Got1P05201 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Got1P05201 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Got1P05201 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Got1P05201 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Got1P05201 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Got1P05201 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Got1P05201 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Got1P05201 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Got1P05201 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Got1P05201 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Got1P05201 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Got1P05201 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Got1P05201 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Got1P05201 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Got1P05201 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Got1P05201 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Got1P05201 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Got1P05201 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Got1P05201 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Got1P05201 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Got1P05201 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Got1P05201 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Got1P05201 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Got1P05201 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Got1P05201 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Got1P05201 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Got1P05201 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Got1P05201 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Got1P05201 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Got1P05201 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Got1P05201 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Got1P05201 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Got1P05201 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Got1P05201 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Got1P05201 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Got1P05201 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Got1P05201 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Got1P05201 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Got1P05201 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Got1P05201 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Got1P05201 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Got1P05201 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Got1P05201 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Got1P05201 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Got1P05201 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Got1P05201 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Got1P05201 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Got1P05201 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Got1P05201 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Got1P05201 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Got1P05201 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Got1P05201 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Got1P05201 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Got1P05201 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Got1P05201 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Got1P05201 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Got1P05201 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Got1P05201 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Got1P05201 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Got1P05201 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Got1P05201 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Got1P05201 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Got1P05201 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Got1P05201 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Got1P05201 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Got1P05201 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Got1P05201 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Got1P05201 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Got1P05201 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Got1P05201 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Got1P05201 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Got1P05201 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Got1P05201 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Got1P05201 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Got1P05201 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Got1P05201 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Got1P05201 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms