Protein–RNA interactions for Protein: P04919

Slc4a1, Band 3 anion transport protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a1P04919 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Slc4a1P04919 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc4a1P04919 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc4a1P04919 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc4a1P04919 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc4a1P04919 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc4a1P04919 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Slc4a1P04919 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc4a1P04919 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc4a1P04919 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc4a1P04919 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc4a1P04919 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc4a1P04919 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms