Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P04214 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P04214 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P04214 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P04214 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P04214 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P04214 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P04214 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P04214 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P04214 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P04214 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P04214 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P04214 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
P04214 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
P04214 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
P04214 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
P04214 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P04214 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P04214 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P04214 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P04214 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P04214 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P04214 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P04214 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P04214 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
P04214 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P04214 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P04214 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P04214 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
P04214 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P04214 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P04214 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P04214 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P04214 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P04214 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P04214 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P04214 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P04214 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P04214 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P04214 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P04214 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P04214 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P04214 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P04214 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P04214 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P04214 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P04214 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P04214 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P04214 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
P04214 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P04214 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P04214 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P04214 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P04214 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P04214 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P04214 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
P04214 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P04214 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
P04214 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
P04214 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P04214 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P04214 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P04214 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P04214 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P04214 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P04214 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P04214 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
P04214 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P04214 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
P04214 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.33■■□□□ 1
P04214 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
P04214 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P04214 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P04214 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.32■■□□□ 1
P04214 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.32■■□□□ 1
P04214 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC21.32■■□□□ 1
P04214 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P04214 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P04214 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P04214 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
P04214 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P04214 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P04214 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P04214 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P04214 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P04214 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
P04214 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC21.31■■□□□ 1
P04214 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P04214 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P04214 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P04214 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P04214 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P04214 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P04214 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
P04214 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.3■■□□□ 1
P04214 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
P04214 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P04214 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P04214 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P04214 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms